Помимо разделения по способу описания данных, на базы данных можно взглянуть и с другой стороны, а именно – с точки зрения самих данных, для хранения которых они предназначены. Здесь можно отметить два больших принципиально разных класса. Документальная база данных хранит записи, которые отражают документ и содержат его библиографическое описание и, возможно, иную информацию о нем. Фактически она может хранить сильно неструктурированные данные. В то же время, фактографическая база данных хранит записи, которые содержат данные непосредственно о состоянии внешнего мира (описание предметной области), не опосредованные ссылками на отражающие их документы, а значит – гораздо более структурируемые данные.

Отдельно в ряду современных баз данных с точки зрения обрабатываемой информации стоят геоинформационные базы данных, предназначенные для хранения геоинформационных данных (карт, схем дорог и так далее). Геоинформационные технологии получают в настоящее время широкое распространение, а геоинформационные системы (ГИС) занимают достойное место в ряду информационных систем различного назначения. Востребованность такого рода технологий определяется, прежде всего, специфическими свойствами, присущими только ГИС.

Стремительное развитие web-технологий также привело к возникновению особого рода баз данных – XML-баз данных (XML-ориентированные СУБД), предназначенных для работы с современными web-узлами, многие из которых основаны на технологии XML. Основной задачей такой базы данных является хранение XML-данных, а также всех компонент XML-модели, а также обеспечение эффективной работы с хранимой информацией. Особенностью таких данных является то, что XML-документы могут содержать мегабайты текстовых строк и тегов XML. Такие документы имеют иерархическую структуру, и лучше оставить эту иерархию в неизменном виде, ведь поиск в этом случае окажется гораздо более эффективным.